答：东北地区购进船舶的运输企业向主管税务机关申请退税时，需要提供的资料主要有：

1、船舶登记管理部门出具的表明船籍港为“中国洋浦港”的《船舶所有权登记证书》。

2、运输企业及购进船舶从事国际运输和港澳台运输业务的证明文件。

从事国际散装液体危险货物和旅客运输的，需要提交有效的《国际船舶运输经营许可证》和《国际海上运输船舶备案证明书》。

从事国际集装箱和普通货物运输的，需要提交有效的交通运输管理部门备案证明材料。

从事内地往返港澳散装液体危险货物和普通货物运输的，需要提交有效的交通运输管理部门备案证明材料。

从事大陆与台湾地区间运输的，需要提交有效的《台湾海峡两岸间水路运输许可证》和《台湾海峡两岸间船舶营运证》。

3、此外，还需要提供主管税务机关要求提供的其他材料。